9月13日，英法舰队开始对福州海面实施封锁（2-25）。

9月14日，陆战旅和荣一师一团向被包围的英军第26苏格兰步兵团和法国志愿骑兵连发起总攻，并于次日将敌全歼，俘虏了第26苏格兰步兵团团长亨利·麦肯森上校，后按照杨沪生之令将其交给天京处置（2-25）。

9月15日，杨沪生在会见罢工工人代表时提出了建立工会的意见；根据地建造的第一艘远洋军舰“郑和号”在马尾造船厂下水（2-23）。

9月16日，张海强、邱海波抵达湖口要塞工地视察，要求在30日内无论如何将要塞建设完成（2-26）。

9月20日，解放军第二军以下属第一、第二、第三、第四、第五师和机动第二、第四、第八旅于中午向长沙发起总攻，当日即攻克长沙，击毙清廷两江总督、大学士曾国藩，湘军重将曾国荃等，两湖战役结束，解放军全歼湘军，解放湖南全境，将清廷南北方的陆路联系彻底切断，并夺取了南方最重要的产粮区，为未来战争的胜利打下了坚实的基础（2-26）。

9月25日，杨沪生从福州返回赣州（2-28）。

9月28日，参加两湖战役的解放军部队返回江西，在赣州召开了全军师以上部队首长会议，会上杨沪生下达了开展两广战役的命令，并对即将开始的与英法干涉军的战斗进行了动员（2-28）

9月底，清廷恭亲王奕訢在得知长沙失守后狗急跳墙，试图派人劝降杨沪生和史秉誉（2-27）。

10月，英法主力舰队抵达上海，准备开始对中国的干涉行动。

士迪佛立提出扶植李鸿章在长江流域成立傀儡政权分裂中国的建议。

在会晤李鸿章时又提出将定海作为英法海军舰队中转基地的要求（2-27）。

10月，由人民军第一军和第二军改编而成的解放军第十一旅、第十二旅、第十三旅，以及解放军第四师组成南方集群，挺进广东开始两广战役，以牵制将要经过香港的英军援军。

在攻占韶州后邱明提出停止攻打广州转向西进，经梧州攻击广西的计划，但被杨沪生否决，并要求南方集群从全局出发，坚决执行原作战计划，仅派出小部队虚张声势进入广西。

同时杨沪生指示作战部派遣精干部队进入川鄂、豫鄂地区与石达开和捻军取得联系，在敌后建立根据地。

根据地决定建立第一条商业铁路，并向私人投资者开放卷烟业的建设权（2-28）。

为确保湖口要塞而建设的九江与梅家洲之间的军用铁路投入运行（2-26）。

11月，史秉誉完成在美国的出访任务，在美国设立了商务代办处，并离开美国秘密前往欧洲考察（2-38）。

此外，史秉誉还与联邦政府签订了中美通商密约，在中美之间实现全面开放，并在经济上给予美国公民以国民待遇，而美国也取消在华的领事裁判权（2.

2-11）。

11月上旬，解放军南方集群攻克广州，清廷两广总督、广东巡抚自杀。

同时解放军突击队开始为即将进行的在天京的秘密行动开始最后的封闭训练（2-29）。

11月中旬，英法联军和清军在海军配合下包围天京（2-29）。

12月初，清军在英法联军配合下攻占天京外围据点钟山（2-29）。

12月13日，清军于凌晨突袭攻占天京外围制高点天堡城，并于入夜时攻占天京外围最后一个据点地堡城。

同日，解放军突击队抵达天京，准备和军事情报部部长竺泽生一同执行杨沪生的命令，将洪秀全、洪仁轩等太平天国重要官员和一批重要文献、物资等抢救出天京（2-29）。

12月14日，清军和英法联军于黄昏时攻破天京城防，天京沦陷。

天王洪秀全与幼天王自杀身亡。

解放军突击队展开行动，将洪仁轩、林绍璋和洪秀全两名幼子等重要人物救出天京，并成功挑起了清军与英法联军之间的大规模内讧（2-29、2-30）。

12月15日，因亨利·麦肯森被洪秀全处死，士迪佛立下令屠杀了全部太平军俘虏（2-30）。

12月中旬，洪仁轩、林绍璋等人抵达根据地，杨沪生立即将参议会议长一职交给洪仁轩担任（2-30）。

1863年，解放军南方集群向广西、云贵挺进，当地各族人民纷纷起义响应，解放军轻易解放三省（2-40）。

1863年，解放军在福建马尾建立了马尾初级海军军官学校（3-9）。

1864年

1864年，解放军研制成功双基炸药（2-33）。

1月，在湖北的捻军主力被僧格林沁歼灭，张海强率领解放军第二军以三个主力师北渡长江进入大别山区寻求与僧格林沁部清军决战未果（2-31）。

太平军李世贤部被李鸿章击败，为解放军荣一师所救后放弃杭州，退守绍兴、金华（2-32）。

2月16日，英国舰队抵达湖口要塞，湖口战役打响。

诺尔·阿思本率领的先头舰队遭到重创（2-31）。

解放军第二军南撤至湖北黄陂（2-32）。

2月17日，英国主力舰队抵达马垱，三千名英军陆战队员在湖口下游彭泽登陆，进攻湖口要塞东部的华山要塞，被装备机枪的解放军第五师第十旅击退。
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